Microbiome intestinal : votre allié (ou ennemi) invisible

Saviez-vous que votre corps abrite des milliards de micro-organismes qui influencent votre digestion, votre immunité… et même votre humeur ?

Ce monde microscopique, c’est votre microbiote intestinal.

Véritable chef d’orchestre de votre santé, plongeons dans cet univers fascinant et souvent méconnu.

Qu’est-ce que le microbiome ?

Le microbiome désigne l'ensemble des micro-organismes vivant dans un environnement spécifique du corps humain, comme la peau, la bouche, les poumons… ou l’intestin !

Ces micro-organismes cohabitent avec nous en symbiose, jouant souvent un rôle crucial dans notre santé.

Quand on parle de micro-organismes dans un microbiome, il s'agit d'organismes vivants microscopiques, invisibles à l'œil nu, qui comprennent :

• Des bactéries
• Des virus
• Des champignons unicellulaires (comme les levures)
• Des protistes (organismes unicellulaires avec un noyau)
• Parfois aussi des archées (microbes primitifs)

Qu’est-ce que le microbiote intestinal ?

Le microbiote intestinal réside dans notre intestin, principalement dans le côlon. On parle parfois de "flore intestinale".

Chez un adulte, il comprend entre 10 000 et 100 000 milliards de micro-organismes, soit autant, voire plus, que nos propres cellules humaines.

Cette composition est unique à chaque personne.

Le microbiote intestinal joue plusieurs rôles essentiels :

• Digestion : il aide à dégrader des aliments complexes (notamment les fibres végétales) et produit des nutriments essentiels.
• Immunité : il éduque notre système immunitaire et empêche l’implantation de bactéries pathogènes.
• Santé mentale : il peut influencer l’humeur via l’axe intestin-cerveau.
• Santé globale : il agit sur le métabolisme, le poids, le glucose, les lipides et d’autres paramètres.

Déséquilibre du microbiote : quels symptômes ?

Un microbiote déséquilibré (ou dysbiose) peut provoquer :

Troubles digestifs 

gaz, ballonnements, diarrhées, constipation, douleurs abdominales, mauvaise absorption.

Déficit immunitaire & infections fréquentes

La dysbiose affaiblit le système immunitaire, rendant l’organisme plus vulnérable aux infections (rhumes, infections urinaires, maladies opportunistes).

Inflammation & maladies chroniques

Un déséquilibre du microbiote favorise l’inflammation chronique, pouvant conduire à des maladies inflammatoires de l’intestin (maladie de Crohn, rectocolite hémorragique), à des pathologies métaboliques (obésité, diabète de type 2), à des maladies cardiovasculaires, et même à certains cancers.

Allergies et intolérances alimentaires

La dysbiose est associée à une augmentation des allergies (asthme, éruptions cutanées), et des intolérances alimentaires car l’organisme plus réactif à certains aliments. 

Prise de poids

Un microbiome déséquilibré influence l’absorption des calories, le stockage des graisses et la régulation de l’appétit, favorisant la prise de poids.

Mais il peut être la cause de beaucoup d’autres symptômes…

Fatigue chronique, acné, cystites, douleurs musculaires ou articulaires, et infertilité peuvent aussi être liés à une dysbiose.

Ce qui favorise un microbiote sain :

Ce qui appauvrit le microbiote :

Comment restaurer le microbiome intestinal ?

Des chercheurs ont découvert que des colocataires partagent un microbiote plus similaire que des membres d'une même famille vivant séparément.

Preuve que le mode de vie impacte plus que la génétique !

À retenir :

• Votre mode de vie et votre alimentation ont un impact direct et puissant sur votre microbiome. Il n’est jamais trop tard pour l’améliorer !
• Même après des perturbations (antibiotiques, maladie…), le microbiome peut se rééquilibrer grâce à de bonnes habitudes.

Les tests du microbiome

Un test du microbiote intestinal consiste à analyser la composition des bactéries et autres micro-organismes présents dans tes intestins, généralement à partir d’un échantillon de selles.

Le test mesure la diversité des espèces bactériennes. D’identifier quelles espèces de bactéries, champignons, virus et autres micro-organismes sont présentes et en quelles proportions.

Les résultats peuvent être comparés à des profils de microbiomes sains ou pathologiques pour aider à interpréter les anomalies.

Ce test permet de detecter les potentiels déséquilibre, et ainsi de pouvoir agir en conséquence grâce à :

• Personnalisation de l’alimentation et des soins : Les résultats permettent d’adapter son alimentation ou de prendre des probiotiques ciblés pour rééquilibrer le microbiote.
• Prévention : Détecter un déséquilibre avant l’apparition de maladies ou de troubles digestifs.
• Suivi de l’évolution : Évaluer l’impact de changements de mode de vie, de traitements ou de régimes alimentaires sur la santé intestinale.

Les différentes méthodes de test

Les technologies utilisés dans les différents tests microbiote sont basée sur l’ADN ou l’ARN.

• ADN (16S, shotgun) : Informe sur qui est présent et ce qu’ils pourraient faire.
• ARN (métatranscriptomique) : Révèle ce qu’ils font réellement à un instant donné.

 

🧬 1. Séquençage 16S rRNA

Identification des genres bactériens dominants via le gène 16S commun à toutes les bactéries.

🧬 2. Shotgun Métagénomique

Analyse de tout l’ADN présent : identifie bactéries, virus, champignons, etc. + estimation de leur abondance.

🧬 3. Métatranscriptomique

Analyse de l’ARN microbien pour déterminer quelles fonctions sont activées en temps réel.

En résumé

Conclusion

Faire un test du microbiome peut vous donner une photographie précise de votre santé intestinale, utile pour prévenir, comprendre ou accompagner des problèmes digestifs, immunitaires ou métaboliques.

C’est un outil de personnalisation de votre hygiène de vie et alimentation.

Le test du microbiome Lucis

Chez Lucis, nous croyons qu’il est essentiel de vous donner les moyens d’agir pour votre santé.

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